Dr Michał Gabruk
adiunkt
adres e-mail: michal.gabruk@uj.edu.pl
telefon: +48 12 664 65 63
pokój: B222 (3.1.26)
Zainteresowania badawcze
- Struktura, funkcja i ewolucja fotoenzymów.
- Regulacja szlaku biosyntezy chlorofilu w roślinach okrytonasiennych.
- Białka remodelujące błony lipidowe.
- Filogenetyczne narzędzia w badaniu ewolucji białek.
- Ewolucja molekularna enzymów szlaku biosyntezy chlorofilu.
Techniki badawcze
- Klonowanie i heterologiczna ekspresja białek
- Punktowa mutageneza
- Niskotemperaturowe pomiary fluorescencji
- Mikroskopia krio-elektronowa
- Ukierunkowana ewolucja molekularna
- Narzędzia filogenetyki molekularnej
Życiorys naukowy
Od 10/2019r. – adiunkt w Zakładzie Fizjologii i Biochemii Roślin.
01/2019-01/2020 – staż podoktorski na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco, USA.
2018 r. – stypendium im. Bekkera przyznawane przez Narodową Agencję Wymiany Akademickiej.
2018 r. – stypendium START przyznawane przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej.
Od 2018r. – asystent naukowy w Zakładzie Fizjologii i Biochemii Roślin.
2017r. – obrona pracy doktorskiej.
2017r. – półroczny staż na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco, USA.
2016r. - ukończenie interdyscyplinarnego programu studiów doktoranckich Społeczeństwo, Technologie, Środowisko - SET.
2013 r. – stypendium wyjazdowe Polskiego Towarzystwa Biochemicznego na IX Konferencję Parnasa w Jerozolimie.
Od 2008 roku związany z Zakładem Fizjologii i Biochemii Roślin.
Projekty
Kierownik projektu, projekt SONATA NCN 2019/35/D/NZ1/00295 Kierowana ewolucja molekularna i uczenie maszynowe w badaniach nad zależną od światła oksydoreduktazą protochlorofilidu (2019-2023).
Kierownik projektu, projekt Grant dla młodych naukowców Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ MNS 9/2020 Molekularny mechanizm tworzenia i rozpadu filamentów LPOR (2020-2021).
Kierownik projektu, projekt im. BEKKERA NAWA PPN/BEK/2018/1/00105 Structural properties and function of the oligomers of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase (2019)
Kierownik projektu, projekt ETIUDA NCN 2016/20/T/NZ1/00518 Oligomeryzacja i wiązanie substratów w oksydoreduktazie protochlorofilidu (2016-2017).
Kierownik projektu, projekt Grant dla młodych naukowców Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ BMN 18.1-3/2016 Poszukiwanie inhibitorów zależnej od światła oksydoreduktazy protochlorofilidu (2016-2017).
Kierownik projektu, projekt PRELUDIUM NCN 2013/09/N/NZ1/00200 Oligomerization control and tetrapyrrole binding in protochlorophyllide oxidoreductase (2014-2016).
Publikacje
- Gabruk, M., & Mysliwa-Kurdziel, B. (2020). The origin, evolution and diversification of multiple isoforms of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase (LPOR): focus on angiosperms. Biochemical Journal, 477(12), 2221-2236.
- Gabruk, M., Mysliwa-Kurdziel, B., & Kruk, J. (2017). MGDG, PG and SQDG regulate the activity of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase. Biochemical Journal, 474(7), 1307-1320.
- Gabruk, M., Nowakowska, Z., Skupien-Rabian, B., Kędracka-Krok, S., Mysliwa-Kurdziel, B., & Kruk, J. (2016). Insight into the oligomeric structure of PORA from A. thaliana. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Proteins and Proteomics,1864(12), 1757-1764.
- Dłużewska, J., Szymańska, R., Gabruk, M., Kós, P. B., Nowicka, B., & Kruk, J. (2016). Tocopherol cyclases—substrate specificity and phylogenetic relations. PloS one, 11(7), e0159629.
- Szymańska, R., Kołodziej, K., Ślesak, I., Zimak-Piekarczyk, P., Orzechowska, A., Gabruk, M., Żądło, A., Habina, I., Knap, W., Burda, K., Kruk, J.(2016). Titanium dioxide nanoparticles (100–1000 mg/l) can affect vitamin E response in Arabidopsis thaliana. Environmental Pollution, 213, 957-965.
- Gabruk, M., Habina, I., Kruk, J., Dłużewska, J., & Szymańska, R. (2016). Natural variation in tocochromanols content in Arabidopsis thaliana accessions–the effect of temperature and light intensity. Physiologia plantarum 157, 147-106.
- Gabruk, M., Mysliwa-Kurdziel, B. (2015). Light-Dependent Protochlorophyllide Oxidoreductase: Phylogeny, Regulation, and Catalytic Properties. Biochemistry,54(34), 5255-5262
- Gabruk, M., Stecka, A., Strzalka, W., Kruk, J., Strzalka, K., Mysliwa-Kurdziel, B. (2015). Photoactive protochlorophyllide-enzyme complexes reconstituted with PORA, PORB and PORC proteins of A. thaliana: fluorescence and catalytic properties. PloS one, 10(2), e0116990.
- Szymańska, R., Nowicka, B., Gabruk, M., Glińska, S., Michlewska, S., Dłużewska, J., Sawicka A., Kruk J., Laitinen, R. (2014). Physiological and antioxidant responses of two accessions of Arabidopsis thaliana in different light and temperature conditions. Physiologia Plantarum 154(2), 194-209
- Gabruk, M., Grzyb, J., Kruk, J., Mysliwa-Kurdziel, B., (2012) Light-dependent and light-independent protochlorophyllide oxidoreductases share similar sequence motifs—in silico studies. Photosynthetica 50: 529-540.