Dr Michał Gabruk

adiunkt

adres e-mail: michal.gabruk@uj.edu.pl

telefon: +48 12 664 65 63

pokój: B222 (3.1.26)

Zainteresowania badawcze

  • Struktura, funkcja i ewolucja fotoenzymów.
  • Regulacja szlaku biosyntezy chlorofilu w roślinach okrytonasiennych.
  • Białka remodelujące błony lipidowe.
  • Filogenetyczne narzędzia w badaniu ewolucji białek.
  • Ewolucja molekularna enzymów szlaku biosyntezy chlorofilu.

Techniki badawcze

  • Klonowanie i heterologiczna ekspresja białek
  • Punktowa mutageneza
  • Niskotemperaturowe pomiary fluorescencji
  • Mikroskopia krio-elektronowa
  • Ukierunkowana ewolucja molekularna
  • Narzędzia filogenetyki molekularnej

Życiorys naukowy

Od 10/2019r. – adiunkt w Zakładzie Fizjologii i Biochemii Roślin.

01/2019-01/2020 – staż podoktorski na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco, USA.

2018 r. – stypendium im. Bekkera przyznawane przez Narodową Agencję Wymiany Akademickiej.

2018 r. – stypendium START przyznawane przez Fundację na rzecz Nauki Polskiej.

Od 2018r. – asystent naukowy w Zakładzie Fizjologii i Biochemii Roślin.

2017r. – obrona pracy doktorskiej.

2017r. – półroczny staż na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco, USA.

2016r. - ukończenie interdyscyplinarnego programu studiów doktoranckich Społeczeństwo, Technologie, Środowisko - SET.

2013 r. – stypendium wyjazdowe Polskiego Towarzystwa Biochemicznego na IX Konferencję Parnasa w Jerozolimie.

Od 2008 roku związany z Zakładem Fizjologii i Biochemii Roślin.

Projekty

Kierownik projektu, projekt SONATA NCN 2019/35/D/NZ1/00295 Kierowana ewolucja molekularna i uczenie maszynowe w badaniach nad zależną od światła oksydoreduktazą protochlorofilidu (2019-2023).

Kierownik projektu, projekt Grant dla młodych naukowców Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ MNS 9/2020 Molekularny mechanizm tworzenia i rozpadu filamentów LPOR (2020-2021).

Kierownik projektu, projekt im. BEKKERA NAWA PPN/BEK/2018/1/00105 Structural properties and function of the oligomers of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase (2019)

Kierownik projektu, projekt ETIUDA NCN 2016/20/T/NZ1/00518 Oligomeryzacja i wiązanie substratów w oksydoreduktazie protochlorofilidu (2016-2017).

Kierownik projektu, projekt Grant dla młodych naukowców Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ BMN 18.1-3/2016 Poszukiwanie inhibitorów zależnej od światła oksydoreduktazy protochlorofilidu (2016-2017).

Kierownik projektu, projekt PRELUDIUM NCN 2013/09/N/NZ1/00200 Oligomerization control and tetrapyrrole binding in protochlorophyllide oxidoreductase (2014-2016).

Publikacje

Google Scholar

  1. Gabruk, M., & Mysliwa-Kurdziel, B. (2020). The origin, evolution and diversification of multiple isoforms of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase (LPOR): focus on angiosperms. Biochemical Journal, 477(12), 2221-2236.
  2. Gabruk, M., Mysliwa-Kurdziel, B., & Kruk, J. (2017). MGDG, PG and SQDG regulate the activity of light-dependent protochlorophyllide oxidoreductase. Biochemical Journal, 474(7), 1307-1320.
  3. Gabruk, M., Nowakowska, Z., Skupien-Rabian, B., Kędracka-Krok, S., Mysliwa-Kurdziel, B., & Kruk, J. (2016). Insight into the oligomeric structure of PORA from A. thaliana. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Proteins and Proteomics,1864(12), 1757-1764.
  4. Dłużewska, J., Szymańska, R., Gabruk, M., Kós, P. B., Nowicka, B., & Kruk, J. (2016). Tocopherol cyclases—substrate specificity and phylogenetic relations. PloS one, 11(7), e0159629.
  5. Szymańska, R., Kołodziej, K., Ślesak, I., Zimak-Piekarczyk, P., Orzechowska, A., Gabruk, M., Żądło, A., Habina, I., Knap, W., Burda, K., Kruk, J.(2016). Titanium dioxide nanoparticles (100–1000 mg/l) can affect vitamin E response in Arabidopsis thaliana. Environmental Pollution, 213, 957-965.
  6. Gabruk, M., Habina, I., Kruk, J., Dłużewska, J., & Szymańska, R. (2016). Natural variation in tocochromanols content in Arabidopsis thaliana accessions–the effect of temperature and light intensity. Physiologia plantarum 157, 147-106.
  7. Gabruk, M., Mysliwa-Kurdziel, B. (2015). Light-Dependent Protochlorophyllide Oxidoreductase: Phylogeny, Regulation, and Catalytic Properties. Biochemistry,54(34), 5255-5262
  8. Gabruk, M., Stecka, A., Strzalka, W., Kruk, J., Strzalka, K., Mysliwa-Kurdziel, B. (2015). Photoactive protochlorophyllide-enzyme complexes reconstituted with PORA, PORB and PORC proteins of A. thaliana: fluorescence and catalytic properties. PloS one, 10(2), e0116990.
  9. Szymańska, R., Nowicka, B., Gabruk, M., Glińska, S., Michlewska, S., Dłużewska, J., Sawicka A., Kruk J., Laitinen, R. (2014). Physiological and antioxidant responses of two accessions of Arabidopsis thaliana in different light and temperature conditions. Physiologia Plantarum 154(2), 194-209
  10. Gabruk, M., Grzyb, J., Kruk, J., Mysliwa-Kurdziel, B., (2012) Light-dependent and light-independent protochlorophyllide oxidoreductases share similar sequence motifs—in silico studies. Photosynthetica 50: 529-540.