Cykl ksantofilowy roślin wyższych, glonów i okrzemek; analiza deepoksydacji w błonach tylakoidów i w układach modelowych;
Rola barwników biologicznych (barwniki roślinne, bakteryjne, grzybowe) w odpowiedzi na biotyczne i abiotyczne czynniki środowiska;
Molekularne mechanizmy odpowiedzi autotrofów na czynniki abiotyczne (światło, temperatura, metale przejściowe); środowiskowa regulacja biosyntezy chlorofilu i karotenoidów; rola oligomeryzacji fotosystemu I u cyjanobakterii, adaptacje roślin do podwyższonych stężeń metali ciężkich;
Błony fotosyntetyczne u roślin wyższych – biosynteza chlorofilu;
Ocena wpływu zmian strukturalnych na stabilność molekuł;
Charakterystyka oddziaływań molekularnych białek, przeciwciał, kwasów nukleinowych i innych biomolekuł z macierzą błon biologicznych;
Przemiany fazy termotropicznej w formowaniu lipidów;
Zmiany płynności błon i ich wpływ na błony biologiczne;
Analiza prenyllipidów w roślinach i ich funkcja antyoksydacyjna;
Nietypowe mechanizmy fotosyntetycznego transportu elektronów;
Zmiany płynności błon;
Nietypowe drogi transportu elektronów w aparacie fotosyntetycznym;
Mechanizmy transferu energii i elektronów w kompleksach fotosyntetycznych - badania w układach modelowych;
Regulacja biosyntezy i biodegradacji barwników fotosyntetycznych;
Mechanizmy formowania się fotosyntetycznych kompleksów barwnikowo-białkowych;
Spektroskopowe właściwości chlorofili i karotenoidów;
Prooksydacyjne właściwości karotenoidów;
Synteza modelowych barwników fotosyntetycznych i fotosensybilizatorów dla zastosowań w terapii fotodynamicznej- modyfikacje chlorofili i bakteriochlorofili;
Chlorofile jako ksenobiotyki - interacje ze zwierzęcym i ludzkim organizmem;
Wpływ metali ciężkich na kiełkowanie nasion, fizjologie, biochemię, i genetykę roślin z terenów pokopalnianych w hodowlach in vitro;
Adaptacje roślin do stresu wywołanego przez obecność metali ciężkich ze źródeł antropogenicznych;
Rośliny i mikroorganizmy w bioremediacji;
Zastosowanie autotrofów w fitoremediacji i biotransformacji ścieków;
Ekstremofile i molekularne mechanizmy adaptacji do warunków stresowych;